دانشکده علوم از بدو شروع به کار دانشگاه در سال۱۳۵۵ جذب دانشجو داشته که کار خود را در ساختمان های استیجاری به عنوان مجتمع آموزشی آغاز نموده است . در ۱۶ خرداد ۱۳۵۵، کار ساختمانی و پی ریزی دانشگاه آغاز شده ، ساختمان دانشکده از قدیمی ترین ساختمان دانشگاه بوعلی سینا است که از نظر معماری و فنی مهندسی منحصر بفرد بوده و در وزارت علوم ، تحقیقات و فناوری ساختمان یونیک اعلام شده است.
در حال حاضر این دانشکده ، بزرگترین دانشکده در دانشگاه بوعلی سینا است که در مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری دانشجو دارد .
با توسعه دانشگاه به تدریج سازمان مرکزی ، دانشکده ادبیات ، اقتصاد و علوم اجتماعی از این ساختمان خارج گردیده اند . هم اکنون دانشکده علوم پایه و شیمی در این ساختمان واقع شده اند و بزودی دانشکده شیمی نیز به ساختمان در شرف اتمام نقل مکان می کنند. لازم به ذکر است گروه شیمی یکی از گروه های دانشکده علوم بوده که در سال ۱۳۸۵ موفق به تشکیل دانشکده شیمی شده و از دانشکده علوم منفک گردیده اند.
در حال حاضر این دانشکده ، بزرگترین دانشکده در دانشگاه بوعلی سینا است که ۶۵ عضو هیات علمی و ۱۸۵۷ دانشجو ، که ۴۷۸ نفر آنها در مقطع کارشناسی ارشد و ۱۲۱ نفر در مقطع دکتری تحصیل می کنند.
در حال حاضر این دانشکده ۵ گروه آموزشی دارد:که شامل گروه های آمار ،ریاضی ،فیزیک ،زمین شناسی و زیست شناسی می باشد.